作为药用的沉香的作用与功效主要是降气温中，暖肾纳气，但是阴虚火旺、气虚下陷的人应该慎重服用。作为食疗，沉香气香行散，降而能升具有行气温中降逆，暖肾纳气平喘的功效，主治气逆喘息，呕吐呃逆，脘腹胀痛，腰膝虚冷，大肠虚秘，小便气淋，男子精冷。
此外，沉香的药理作用也可表现在对消化道系统的作用：沉香的水煮液和水煮醇沉液能抑制离体豚鼠回肠的自主收缩，对抗组胺、乙酰胆碱引起的痉挛性收缩;呈现肠平滑肌解痉作用。
